日本サッカー協会（JFA）は、天皇杯 JFA 第100回全日本サッカー選手権大会に出場する都道府県代表47チームが決定したことを受け、その47チームを発表した。

アマチュアシードとして出場するHonda FCを加え、9月16日にいよいよサッカー日本一を決めるトーナメントが開幕するという。

出場チームは以下。（）内は出場回数。

  • 北海道    札幌大学（24）
  • 青 森      ラインメール青森（3）
  • 岩 手      富士大学（2）
  • 宮 城      ソニー仙台FC（21）
  • 秋 田      猿田興業（初）   
  • 山 形      大山サッカークラブ（初）
  • 福 島      いわきFC（4）   
  • 茨 城      筑波大学（31）
  • 栃 木      栃木シティFC（11）
  • 群 馬      tonan前橋（5）
  • 埼 玉      東京国際大学（7）
  • 千 葉      VONDS市原FC（3）
  • 東 京      東京武蔵野シティFC（5）
  • 神奈川    桐蔭横浜大学（4）
  • 山 梨      山梨学院大学ペガサス（3）
  • 長 野      アルティスタ浅間（初）
  • 新 潟      新潟医療福祉大学（5）
  • 富 山      富山新庄クラブ（7）
  • 石 川      金沢星稜大学（2）
  • 福 井      福井ユナイテッドFC（12）
  • 静 岡      常葉大学（4）
  • 愛 知      FCマルヤス岡崎（4）
  • 三 重      鈴鹿ポイントゲッターズ（6）
  • 岐 阜      長良クラブ（初）
  • 滋 賀      MIOびわこ滋賀（8）
  • 京 都      おこしやす京都AC（4）
  • 大 阪      FC TIAMO枚方（初）
  • 兵 庫      Cento Cuore HARIMA（9）
  • 奈 良      奈良クラブ（12）
  • 和歌山    アルテリーヴォ和歌山（12）
  • 鳥 取      Yonago Genki SC（初）
  • 島 根      松江シティFC（7）
  • 岡 山      三菱水島FC（13）
  • 広 島      福山シティFC（初）
  • 山 口      FCバレイン下関（初）
  • 香 川      高松大学（初）
  • 徳 島      FC徳島（5）
  • 愛 媛      松山大学（3）
  • 高 知      高知ユナイテッドSC（5）
  • 福 岡      福岡大学（33）
  • 佐 賀      EVインテルナシオナル（2）
  • 長 崎      MD長崎（4）
  • 熊 本      熊本県教員蹴友団（4）
  • 大 分      ヴェルスパ大分（10）
  • 宮 崎      テゲバジャーロ宮崎（2）
  • 鹿児島    鹿屋体育大学（12）
  • 沖 縄      沖縄SV（2）

上記に加え、アマチュアシード 1チームに、今大会で出場40回目のHonda FCが出場。

前述のとおり、9月16日に開幕となり、新型コロナウイルス感染症のリスクを軽減するためｍ3回戦までは、地域単位での実施となり、5回戦までは、都道府県代表とアマチュアシードで争われるという。

J2およびJ3のチームは優勝チームのみが準々決勝から参戦し、J1は上位2チームのみの参戦。なお、J1の2チームは、準決勝から登場するとのことだ。

決勝戦は2021年1月1日に国立競技場にて行われる。